三層紙箱包裝相對于其他厚度的紙箱包裝，可能存在以下問題：

抗壓性能較差：相對于四層或五層紙箱，三層紙箱的強度和抗壓性能較差。在運輸、儲存等過程中，可能會因為受到擠壓和撞擊而導致紙箱變形或破損。

保護性能有限：相對于更厚的紙箱包裝，三層紙箱的緩沖和抗震性能有限，不能很好地保護包裝物。

不適合重型物品：三層紙箱的載重能力相對較低，不適合用于包裝重型物品。

摩擦力差：三層紙箱的表面光滑度較低，摩擦力較差，可能會導致包裝物在運輸過程中發生滑動。

適用范圍有限：三層紙箱適用于輕型、低價值、不易碎的產品包裝，如服裝、書籍等。對于一些對包裝要求較高的產品，如電子產品、玻璃制品等，可能需要使用更加結實和穩固的紙箱包裝。

需要注意的是，三層紙箱包裝在實際應用中的問題可能因不同的產品和使用環境而有所不同。在選擇包裝材料和設計包裝方案時，應根據具體情況進行綜合考慮，以確保產品的包裝質量和安全性。